中華基督教會「龍門堂｣成立於2009年一月一日，座落於何福堂小學內，前身是中華基督教會「屯門堂｣的佈道所。1999年，在屯門市中心「新發村」的何福堂小學，因西鐵「屯門站」興建的關係，需遷往「龍門居」旁的新校舍。當時的「龍門居」、「富健花園」和「新屯門中心」三個住宅區，有人口逾四萬，卻沒有一間教會。屯門堂看見當地福音工場大，極待開墾，於是聯絡區會和校方，申請在｢何小｣新校舍開設「佈道所」。2001年何小新校舍開學，屯門堂「龍門佈道所」亦開始第一次崇拜聚會。

早期，龍門佈道所在一樓舞蹈室舉行主日崇拜，有五十多人參與。感謝神的帶領，翌年已超過一百人。2004年，崇拜地點移到四樓禮堂內。龍門佈道所也開始朝｢自治｣、｢自養｣、｢自傳｣三自目標，邁向自立之路。｢自治｣指教會的領袖由佈道所本身的會友產生，冶理本堂的教務和人事。｢自養｣指教會有良好的財政狀況，經濟上足以自立和自主。｢自傳｣指教會有自聘的牧者，可培育教會的再生力及宣教心，在本區和各處持續傳揚福音。

屯門堂歷史悠久，由「倫敦傳道會」（London Missionary Society）宣教士創立的。1908年，英國倫敦會與香港愉寧堂，及華人道濟會堂（即今日合一堂）組成「香港新界傳道會」，以其名義租用村屋，創立「青山福音堂」。1918年，「中華基督教會」總會在中國成立，並推行「三自目標」與「合一運動」。倫敦會安排青山福音堂加入，遂稱為「中華基督教會青山福音堂」。後來，正名為「屯門福音堂」，即現時的「中華基督教會屯門堂」。簡而言之，「龍門堂」承傳自倫敦會、新界傳道會、屯門堂和中華基督教會，而中華基督教會是一間跨宗派、合一中，主張本色化的中國教會。